广州大学学报(自然科学版)

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全基因组关联分析的研究现状及对数据科学的挑战

张军英

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 1-9.

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全基因组关联分析(GWAS),是通过考察全基因组范围DNA变异的单核苷酸多态性(SNP),挖掘影响复杂疾病等的表型性状(如疾病、癌症、身高等)的SNP的计算方法,以期为疾病/表型的分子生物发现、生物机理分析、分子靶向药物研究、疾病早期风险预测和个性化治疗等提供科学依据.目前的方法多以统计学、机器学习和深度学习、智能优化等等及其它们的组合为基础,并已取得可喜成绩,但仍有许多无法复现的关联的例子,正如Ioannidis 2005年在国际知名刊物PLoS Medicine上发表、至今已被引用6 600多次的论文中所说“大部分的研究发现是错的”.文章认为,这是因为其核心问题仍未解决,尤其是到底要从数据中挖掘出什么和统计重要性在什么情况下具有科学重要性,以及科学重要性是否可以科学定义等,这些都是GWAS对数据科学的严峻挑战.

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超多目标进化优化研究现状及发展趋势研究

田野, 张兴义

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 10-19.

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超多目标优化问题指同时优化多于3个目标的优化问题,它目前是智能计算领域的热门研究问题之一.在简要介绍超多目标优化问题的概念之后,着重对十多年来提出的超多目标进化算法进行分类介绍,包括基于帕累托支配关系的算法、基于改进支配关系的算法、基于目标分解的算法和基于性能指标的算法.然后,通过实验对比8个具有代表性的超多目标进化算法,并分析不同算法的性能差异.最后,对超多目标进化优化的未来发展提出一些看法.

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蛋白质结构域划分方法及在线服务综述

王燕, 石强, 薛志东

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 20-29.

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蛋白质结构域是研究蛋白质结构、功能与进化的基本单位,不同的结构域可组合出更为复杂的蛋白质分子.划分蛋白质结构域后,可以从结构域的角度研究蛋白质的结构、功能与进化,降低了研究复杂度.根据已知结构的蛋白质统计,有约40%的为多结构域蛋白质,其中还存在一级结构上不临近的氨基酸序列出现在同一个结构域的情况,即不连续结构域.文章给出了当前国内外有关蛋白质结构域边界预测、不连续结构域检测及结构域数据库与在线服务的研究进展,供相关研究者参考.

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通讯膜计算系统研究综述

宋勃升, 徐飞

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 30-36.

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膜计算是自然计算的一个分支,文章主要研究从活细胞的结构和功能中或从组织和器官等细胞群协作中抽象的计算模型.根据膜结构不同,膜计算系统可以分为细胞型膜系统(树状结构)和组织型膜系统或脉冲神经膜系统(任意图结构).细胞间的通讯是膜系统中的一个重要特征,文章讨论的通讯规则是指同向/异向规则,对细胞型和组织型通讯膜系统的研究现状进行概述,从计算能力和计算复杂性方面介绍这2类通讯膜系统的研究进展. 最后给出通讯膜系统中存在的一些问题.

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基于选择集成学习的表面增强拉曼光谱检波算法

柳娟, 曹茂华, 徐志达, 林袁, 刘向荣

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 37-49.

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文章提出了一种表面增强拉曼光谱的检波算法.该算法基于选择性学习和3种经典检波算法,构建了一个组合波峰检测器.结果表明,与传统算法相比,针对波峰提取,作者的算法有更好的正确率和检出率.证明作者的算法是一个可靠的模型,可以用于表面增强拉曼光谱和其他光谱分析的工程应用.

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疾病相关miRNAs识别方法研究进展

许鹏, 昝乡镇, 路德杨, 饶永生, 刘文斌

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 50-60.

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miRNAs是一类内源性短序列非编码RNAs小分子,广泛参与细胞的增殖、分化、凋亡等生物学过程.miRNAs的异常表达与包括肿瘤在内的多种复杂疾病的发生、发展有着密切的关系,筛选与疾病相关的miRNAs,对于药物靶点的发现及新型药物的开发,具有十分重要的作用.笔者拟通过逐步递进的方式,从miRNA靶基因预测、miRNA生物功能作用机制、疾病相关miRNAs计算筛选方法、miRNA小分子药物多个方面,综述疾病相关miRNAs研究进展,为推进miRNA在临床医学中的应用提供参考.

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DNA折纸术——全编程的信息工具

陈从周

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 61-72.

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DNA作为信息分子在构建2D及3D几何形状的纳米级结构上有多种优点.二维和三维结构的组装可以通过DNA链的组合、DNA块的拼接实现.而随着DNA折纸术的出现,更是实现任意平面结构设计的可能.DNA二维平面的设计已被证实是图灵等价的.本文主要介绍基于DNA折纸的计算模型及DNA折纸术在信息领域方面的应用.

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基于透射电子显微镜的纳米颗粒图像识别研究综述

高鹏, 石晓龙

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 73-78.

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对纳米颗粒图像的研究将有助于科研人员更好地了解纳米粒子的性质,传统的研究方法多为人工手动处理,耗时耗力、主观性强、误判率高,已不能满足微纳米研究的需要.而基于图像处理技术的纳米颗粒识别具有快速、准确、实时等特点,能够帮助科研人员及时高效的对纳米颗粒图像进行分析.本文从图像预处理、粒子检测、参数测量等3个方面,分别阐述了图像处理技术在纳米粒子识别中的研究现状和进展,并对今后的研究趋势进行展望.

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国内医疗健康领域移动应用的研究与分析

雷雨琦, 徐颂华

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 79-91.

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随着“互联网+医疗”的快速发展,以及人们的健康意识增强,改变了传统的医疗模式和自我健康管理的方式.在这种趋势下,文章对中国移动健康应用进行综合研究,重点关注其主要功能.选取42个医疗应用和25个健康保健应用作为功能分析的基础,以说明中国移动健康应用的现状.该研究将这些应用的主要功能分为2大类,包括基础核心功能和新兴功能.前一类提供指导咨询、信息资讯、互动社交、预约挂号和在线商城;而后一类则支持门诊线上缴费、健康管理、医护到家、运动激励和远程医疗.文章也指出中国移动健康应用的2个主要局限性,即功能同质性和内容缺乏专业性.

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约定审计费用及其对工作效能及效率的影响

蔡皓峰, 杨忻恺

广州大学学报（自然科学版）. 2019, 18(1): 92-94.

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现有大量研究讨论了审计效率和效果的影响因素,但是鲜有研究将审计费用与审计效果和效率联系起来.为了弥补现有研究的不足,文章从理论上揭示了约定审计费用影响审计效果和效率的具体机制,并得出结论:相较于计时收费,约定审计费用促使审计公司加强管理,提高审计者的专业胜任能力、主动性和独立性,最终提升了审计效果和效率;此外,审计制度和业务约定书的约束有利于审计人员做出专业的判断,进一步加强了约定审计费用对审计效果和效率的促进作用.

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2019年, 第18卷, 第1期　刊出日期：2019-02-28

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